Esta região, Águas Lindas em Goiás a 50 km de Brasília e referida como Parque da Barragem, pertencia ao município de Santo Antônio do Descoberto. Segundo os primeiros moradores, a origem do nome deriva de uma homenagem às nascentes que deram origem a “Águas Lindas”. Na década de 1980, havia apenas algumas fazendas fechadas e fazendas menores.

A necessidade da rodovia BR-070, que era o caminho para o Distrito Federal, proporcionou a migração de inúmeras famílias de Brasília e de outras cidades e vilas próximas, que começaram a se aglutinar ao longo de suas margens, gerando o atual crescimento populacional vertiginoso . A abertura de vários loteamentos aumentou o número de residentes, aumentando rapidamente a população.

Na contagem populacional do ano de 1996 do Conde de 1996 (IBGE), Santo Antônio do Descoberto contava com 107.672 moradores, porém o número de residentes na prefeitura (46.194) era inferior ao da população de Águas Lindas (61.478). Este grupo de moradores motivou as lideranças locais a lançar um aplicativo, buscando a liberdade do município através do Plebiscito realizado em 12 de outubro de 1995, que foi homologado com mais de 92 por cento (noventa e dois percentuais) dos habitantes.

A Lei Estadual nº 12.797, de 27 de dezembro de 1995, estabeleceu Águas Lindas de Goiás como município. Águas Lindas de Goiás foi oficialmente instituída em 1º de janeiro de 1997, quando foram eleitos os primeiros vereadores e prefeitos escolhidos por Águas Lindense.

O governo durou de 1997 a 2000, e o município de Águas Lindas de Goiás foi governado pelo prefeito Odalino Garcia de Melo, o primeiro prefeito eleito por eleição direta. Água Lindas de Goiás é permitida pela eleição direta A Água Lindas de Goiás será administrada a partir de 2021 sob a liderança do Dr. Lucas de Carvalho Antonietti que também é conhecido pelo nome de Dr. Lucas